Wkrótce po Jego nagłym odejściu Rada Pedagogiczna III Liceum Ogólnokształcącego uchwaliła, że Muzeum Kanału Bydgoskiego, unikatowa placówka wymyślona i stworzona przez Sebastiana Malinowskiego, będzie nosić Jego imię.
12 września, podczas wzruszającej uroczystości dokonano odsłonięcia tablicy w muzeum którego Sebastian Malinowski był pierwszym kustoszem.
Kim był człowiek, w którego odejście jeszcze ciągle trudno uwierzyć? Historyk z wykształcenia, miłośnik dziejów Bydgoszczy i Kujaw, nauczyciel, społecznik, autor wielu publikacji poświęconych historii miasta nad Brdą. Także wielki przyjaciel młodzieży, której przekazywał - w sposób jakże niekonwencjonalny - to, co wydaje się być nudne i staroświeckie.
W 2006 r. razem z przyjacielem Adamem Gajewskim otworzył dwa muzea - Wolności i Solidarności oraz Kanału Bydgoskiego.
Pod koniec 2007 r. zaczął prowadzić internetowy pamiętnik (czyli blog, nie lubię tego słowa). Nowy rok witał takim wpisem:
"Zadania, które niegdyś Kazimierz Wielki powierzył w akcie lokacyjnym zasadźcom Janowi i Konradowi, nadając im pustą i niezamieszkałą równinę u stóp zamku królewskiego, by ją ożywili życiem majętnej, miejskiej wspólnoty, w jakimś sensie są adresowane do każdego, kto się z Bydgoszczą identyfikuje.
Sztafeta pokoleń trwa! Z otchłani czasu spoglądają na nas przodkowie. Naszą spuściznę kiedyś przekażemy własnym dzieciom. Nie traćmy czasu! Uwolnijmy entuzjazm bydgoszczan! Wybudźmy miasto z letargu! Wywołajmy kaskadę pozytywnego myślenia i konkretnego działania !
Zróbmy to razem!"
Trudno pogodzić się z tym, że już nic z nami nie zrobi. Miał tyle pomysłów. I tyle rozpoczętych projektów. 4 lutego odszedł nagle. Ale podobno umiera się nie dlatego, by przestać żyć, lecz po to, by żyć inaczej. I tak jest w przypadku Sebastiana Malinowskiego.
Podczas odsłonięcia tablicy memorialnej Wojciech Sobolewski, sekretarz Miejskiego Komitetu Ochrony Pamięci Walki i Męczeństwa przekazał Grażynie Dziedzic, dyrektorce III LO ostatnie zdjęcie zmarłego historyka, wykonane 2 lutego, właśnie w Muzeum Kanału Bydgoskiego.
